比克海流相汇合，成为厄古勒斯海流；另一支流沿海峡中轴北上，流速为36-57厘米/秒，到海峡北口，又与南赤道流-莫桑比克海流汇合，形成逆时针方向环流。12至翌年6月，这支北上海流在马达加斯加西岸形成一系列逆流，成为季节性的马达加斯加西沿岸流。由于莫桑比克海流的存在，海峡表层，终年有一高温水舌沿大陆海岸由东北伸向西南。月平均水温，2-3月最高，大部分水域在28c以上；8月最低，由南向北，约在22-25c之间。水温的垂直结构有明显的层化现象，温跃层随季节而变。4月，跃层深度为50-200米，温度梯度为01c/米；到10月，深度增至400-700米，梯度减弱为002c/米。海峡中部受两岸径流的影响，表层盐度较低，约351-354。深层以200米层为最高，南端可达356以上。因而在50-100米层出现较强的密度跃层。透明度中部较大，达40米。南北两端较小，各为25米和35米。
潮汐属正规半日潮。潮差南北两端较小，东西两岸较大。大潮潮差，南北两端均3米左右，东岸的马任加和西岸的莫桑比克分别为52和48米。平均海平面以南半球的夏、秋季最高、冬季最低，振幅约8-10厘米。
溶解氧以600米层为最高(在50毫升/升以上)，表层次高(约5毫升/升)。1200米层最低，南部为040毫升/升，北部不到25毫升/升。相反，磷酸盐中的磷和硝酸盐中的氮，以1200米处最高，各处22-26和30-35微克-原子/升，表层和近表层最低，各为02和低于10微克-原子/升。但有机磷多集中于近表层。
地质编辑
海峡两侧陆架狭窄，陆坡陡峭。海底由戴维海岭、莫桑比克海盆、马达加斯加边缘台地和科摩罗海盆组成。戴维海岭纵贯海峡中部。海岭的西南面为莫桑比克海盆，因有戴维海岭的屏障，海盆北部沉积物较厚，南部则较浅。海峡底部的沉积物随地形而不同。东西两侧陆架以沙为主，从陆
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