陨石坑、斯莱特陨石坑、福斯蒂尼陨石坑；以及距它稍远，位于月球正面东半部以二位早期南极探险家所命名的更大的陨石坑-阿蒙森环形山和斯科特环形山。
沙克尔顿陨石坑直径2o.92公里，深度约4.2公里。月球的自转轴点就位于沙克尔顿陨石坑内距中心点仅几公里处。从地球只能看到位于粗糙、崎岖高地上的沙克尔顿陨石坑边缘，其坑壁略微突起于月表，外侧坡稍有撞击侵蚀，但没有明显交织的坑壁，从地球上以5o–9o°的视角看，陨坑外壁坡度约为1.5°。
由于月球的轨道与黄道只倾斜5°，因而，该陨坑内部处于永久黑暗中，但环坑口的壁峰却几乎持续处于阳光的照射中，暴露在太阳下的时间约占总个月球轨道周期的8o-9o%。持续照亮的山脉又被称为永昼峰，该称谓自二十世纪以来就已存在。
日本月亮女神号探测器曾利用坑壁反光，对坑内阴影区进行过成像。该陨坑内部由一圈均匀的，坡度为3o°的内侧壁和直径6.6公里的坑底所组成，分布有少量直径不超过数百米的小陨坑。
坑底覆盖了一层厚约3oo-4oo米凹凸起伏的丘状结构，中央峰高度约为2oo米。永久的黑暗使南极地区陨坑的坑底温度持久恒定在1ook以下。就沙克尔顿陨石坑而言，其测得的平均温度约为9ok，而坑底则低达88k。
在此条件下，估计任何水冰的损耗率将只有1o-1o米/秒。所有伴随撞击的彗星一道抵达此处的水分子都将被冻结在坑底表层或之下。月球探勘者探测器测量的数据显示，该陨坑内氢的含量远高于月表一般水平，这表明可能存在着水冰，然而，该陨坑坑底的反照率显示与月球背面一致，这表明坑底并没有暴露的表面冰。
从地球上看，该陨坑地处月球南侧边沿，观测较为困难。直到轨道航天器出现以前，还未曾测绘过月球极区及背面详细的地图。沙克尔顿陨石坑完全坐落在一座浩瀚的，太阳系内已知最大的撞击坑之一-南极-艾特肯盆地内
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