城东南角，于1878年完工。为了使博物馆的高度不超过卫城山上的古建筑，博物馆是挖开土层建成的，除了青铜器和希腊古瓶由国家博物馆保存外，自1834年卫城山各神庙出土的所有文物都保存在这里，包括“扛小牛的男人”、“赤足的有翼胜利女神”及四根存于氮气箱内的伊瑞克提翁神殿女像列柱等珍品。此博物馆对研究和发展古希腊雕刻艺术提供了可贵的资料。
比方说伊瑞克提翁神庙，山门后的伊瑞克提翁神庙建于公元前395年，内部有一雅典娜的木雕像，在这座神庙南侧廊台的六尊女像柱，是属于爱奥尼式的变形，二十一世纪所看到的优美女像列柱结构完美，不至让视觉上产生不自然的现像，不过这些并非真品，由于空气污染，而由复制品取代，要看真品得到卫城博物馆及伦敦的大英博物馆。