也都主张有朱由菘继统，比如淮安巡抚路振分，给史可法的信里就赞成福王继统。给事中李清、章正宸，进士郑元勋等也持同样的态度。
可是南京的大部分官员却反对福王登基，因为历史的原因，南京六部的官员大部分是从北京贬谪而来，大部分都是在崇祯朝失势的东林党人。比如兵部侍郎吕大器、户部尚书高鸿图、右都御史张慎言，詹事府詹事姜曰广等，而在籍的原礼部侍郎钱谦益则是东林党的党魁。
钱谦益两次从老家常熟赶往南京，面见史可法，强烈反对福王登基。原因是朱由菘的祖母是备受神宗宠爱的郑贵妃，神宗喜欢郑贵妃的儿子老福王朱常洵，多次打算废掉崇祯父亲光宗朱常洛的太子之位，改立老福王朱常洵为太子。
围绕着储君之争，东林党人和万历以及郑贵妃进行了多达几十年的争斗，“妖书”、“梃击”、“移宫”一系列的事件发生。经历了东林党人坚持不懈的斗争，神宗和郑贵妃希望立福王朱常洵为太子的图谋才化为泡影。
所以，东林党和福王一系是有深仇大恨的，钱谦益等人害怕福王朱由菘登基之后，会对东林党进行报复。
而史可法本身也是东林党一员，他是东林党重要成员左光斗的弟子，和东林党有千丝万缕的联系，从心理上也对拥立福王有所顾忌。
钱谦益以“立贤”为名，到处游说，提议迎立潞王朱常淓。但是史可法心里，却还是认为应该按伦序立神宗的儿子。朱常淓是神宗的侄子，在血统上偏远，史可法担心舍亲立疏会引起更大的风波。
然而南京群臣大都支持钱谦益，群起而立潞王。无奈之下，史可法暗自决定前往浦口同凤阳总督马士英商量在桂王和福王之中选立一个。因为马士英是凤阳总督，江北的军队如高杰黄得功刘良佐等部都受他的节制，权势颇大。
而对马士英来说，这也是一个千载难逢的机会，参与了拥立，立有拥立之功，以后他将是史可法之下第二人，入阁拜相不在话下。
史可法和马士
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