在《净世》中，世界已经一统，由灵王和幕府组成的贵族集团，以及名为净世庭的忍者武装集团掌控。
普通民众和未接受净世庭招揽的忍者受到压迫，甚至组成了起义军。
净世庭的忍者武装分为十三个番队，掌握净世庭第五番队忍者贵族是春日家。家主年事已高，春日家的孙子为了获得家主的喜爱，带回了时兰。
十四岁的时兰进入了净世庭的忍者学院，在那里认识了许多好友，有来自净世庭之外的平民忍者，还有同样是贵族，却对平民心生好感的正崎铭，这也是这部的另外一位主角。
“时兰大概最后会爱上正崎铭，然后两个人互相扶持吧。”有人这样评论着。
“那个凭借着‘糖、鞭子、苦无’压服忍者莹，从而夺取正室小姐进学名额的春日时兰？你在说笑吧？”另外一个人嗤笑：“时兰肯定不会看上正崎铭了啦，她和那个高傲的春日平涛才是一对。”
另外一边也有人凑了上来：“我觉得春日时兰做的太绝啦！你看她得到了进学名额，但是拜倒在春日平涛脚下的忍者莹不是恨绝了她吗？还经常对她冷嘲热讽。”
“反正我是不会喜欢那种女孩子啦，对着你笑，还能把刀插进你的眼睛里的女孩子。”又有人说。
“不……我倒是觉得我超可的！”一个人又叫道。