四年（公元一五四五年），小尹派发动了“乙巳士祸”，铲除了大尹派的势力，文定王后垂帘听政，与尹元衡及其妻子郑兰贞的专权时代开始了，这也是《女人天下》的原型。
令人咂舌的是，就在这一年，许多大名鼎鼎的人物降生了，其中包括六角义治、增田长盛、山内一丰以及山中幸盛，但是最重量级的人物却是李舜臣，这不能不说是天意。
文定王后通过十几年的专权，弱化了君主的权威和影响力。明宗为了夺回权力扶植沈义谦等外戚牵制尹元衡，日后东人党和西人党的雏形也慢慢形成了。
文定王后薨逝后，沈义谦联合尹元衡的门客金孝元等人，发动政变将尹元衡赶下台，更以毒杀正室夫人的罪名通缉尹元衡之妻郑兰贞。此后朝廷落到了以沈义谦和金孝元为首的士林派的手中。
明宗薨逝后，他的侄子被立为国王，是为宣祖，也就是李昖。明宗的王后仁顺王后开始了垂帘听政，为其弟沈义谦培养势力。这引起了金孝元等另一股士林派强烈的不满，他们千方百计地阻止沈义谦一派进入朝廷中枢。
前辈与后辈两股士林派对峙的局面逐渐形成了，而真正促使这两大势力转变为东人党和西人党的政治事件，就是“乙亥党论”。由于金孝元住在汉城东部、沈义谦住在汉城西部，因此各自以他们两人为中心，形成了东人党（岭南学派）和西人党（畿湖学派）。
此后东人党奉许晔为领袖，而西人党奉朴淳为领袖，他们两个与金孝元和沈义谦一样，都是当年打倒尹元衡的士林派的骨干成员，也保持着相冲突的政见。
许晔依靠出使明朝的机会获取了宗主国的大力支持，在朝廷里担任司法机构的最高官职大司宪；而朴淳也历任了左议政、右议政和领议政等朝廷最高官位。由于他们的加入，东人党和西人党的势力获得了空前的提高，进一步发展到了左右朝政的地步。
宣祖根本无力去制止两大党派争斗，朝政也因党派斗争而荒废，但是朝鲜两百多年的朋党政治时代却刚
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