河又在孟津地区决口。造成了巨大的灾害。朝廷没有能力进行赈灾活动，造成灾民四下里流离失所，从灾民变成流民，从百姓被迫变成了四下里劫掠求生求食的流寇。
崇祯五年十二月。大明官军在朱大典的指挥下包围登州。筑起围墙以围困孔有德所部叛军。在三面距山，一面临海的地形上，筑起了三十里长墙。东西两端都抵答海边。各部明将划分区域分段戍守。孔有德军被压缩在这一狭窄区域内不能出，只能以自家的炮火优势来压制官军。叛军头领李九成出城与明军作战，被明军阵斩。孔有德准备放弃登州出海逃走，却被官军龚正祥等部水师在海口拦截。孔有德虽然击溃明军并俘龚正祥，但是出海逃走的目的却没有达到。
转过年来，便是一连串好坏参半的消息。
被称为流寇的农民军越过山西抵达现在的河北地区，当时被称为真定府所在。赵州、西山、顺德、真定等地先后被攻克，在武安地区，更是大败左良玉军。这位后来的左平贼，此时却被贼平了。
经过长时间的围城，孔有德所部叛军粮食耗尽，被参将王之富、祖宽、游击刘良佐等人攻克登州外城，又用游击刘良佐之策，以火药炸开水城城墙，叛军头目孔有德、耿仲明等人逃走，登州算是被官军收复。这股反叛势力似乎被官军敉平。
而在河北、河南等地流窜的农民军却是连败官军。虽然早期的头目紫金梁在济源被川军邓玘部射杀；但是，在林县追击农民军的杨遇春部却遭到伏击，中伏而死。义军乃用其旗，诱杀其他官军，川军大败，著名的白杆兵土司马凤仪部也在这次战役中被农民军战败。
就在崇祯皇帝忙着对付关内的敌人之时，在关外的后金也来为他助兴。在业已投降后金的孔有德等人的带领下，以偏师攻取旅顺，将驻守在这里的明军黄龙部击败，黄龙本人自刎身亡。
顺便说一句，大家都知道，孔有德所部是被徐光启、孙元化等人花费重金不惜血本打造的一支以西洋火器为主要作战兵器的部队，这几个逆子
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